経費の支払い時に「残高が足りないからこっちの口座（仕事とは無関係の口座）で払おう」とか「ポイントが貯まるし、こっちのカード（普段使ってないカード）で払っちゃおう」というのはオススメしていません。
のちのちの経理のことを考えると手間が増えますし、抜けの原因にもなります。
仕事で使う通帳（会社なら法人口座）から支払っていれば、追跡可能です。
税理士に記帳代行を頼むにも、クラウド会計で同期するにも。
ですが、別の口座で支払ってしまうと記帳代行では、別の通帳を見せて頂かないと税理士には分かりません。
クラウド会計でも同期されていないのであれば、明細が上がっても来ないです。
カードも同じです。
仕事で使っているカードやいつも使っているカードで支払ったほうが良いです。
記帳代行するにもクラウド会計で経理するにも。
「あれ支払ったっけな？」「いくら引き落としされてたっけな？」ということがあります。
仕事でいつも使っている口座やカードであれば、引っ張りだしてくるのは割と容易です。
それをあえて別の口座やカードにしてややこしくする必要はないと思います。
